台灣氣候炎熱潮濕，大部分的中藥材怕潮濕、高溫的環境，久放易變質，因而減低原有的藥效，所以在保存上須特別注意。
傳統科學中藥劑型可以密封，且放置乾燥、通風處，避免讓
陽光直接照射而變質。其他各類保存方法如下提供參考：
濃縮中藥：室溫下放置於陰涼乾燥處，避免日光曝曬及避免潮濕結塊而造成藥物變質。
水煎劑：已煎煮好的藥湯，若未喝完，應存放冰箱冷藏。一般不建議隔夜服用，即使放置在冰箱冷藏室中，也不應超過3天，以免藥液變質影響健康。
中藥飲片：將藥材置於陰涼乾燥處，避免陽光直射；也可置於密封的真空罐裡，隔絕空氣進入，罐子以不透光為佳，但部分藥材因含水量和營養成分高，建議放冰箱內保存，例如枸杞、紅棗、人參、當歸、天門冬…等，若發現中藥材有發霉、變色或是有油敗味時則不宜再使用。
密封真空包：最好在冰箱冷藏室0℃-5℃度範圍內保存，保存期間應在醫師指示用量及處方天數期限內服用完畢。
外用軟膏：在溫度稍高的地方會軟化甚至變質，應避免陽光直接照射並放置在陰涼低溫的環境中，以確保品質。
